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克日，大内存软件的先锋MemVerge和单细胞基因研究的向导者百奥智汇团结宣布，双方乐成行使大内存手艺加速了单细胞核糖核酸测序（scRNA-seq）剖析的时间。与传统的基于DRAM的解决方案相比，由英特尔® Optane™持久内存（PMEM）和MemVerge Memory Machine软件组成的尖端的解决方案让scRNA-seq的加载时间快了800倍，让某些盘算阶段的执行速率提高了25倍。

科学家正依赖基因组测序来识别新的SARS-CoV-2变种，并领会它们将若何影响康健。2月17日，白宫宣布国家疾病控制和预防中央（CDC）将投资近2亿美元，通过基因组测序来识别、跟踪缓和解最新泛起的SARS-COV-2病毒株。

“单细胞核糖核酸测序是推动癌症和COVID-19研究希望的要害基础研究方式之一。我们很自豪能以最先进的单细胞剖析工具引领天下”，百奥智汇生物信息营业主管Chris Kang说。“MemVerge 和英特尔开发的大内存平台加速了我们的事情流程，辅助我们更快地天生效果，这将对未来更好地认知疾病，提高医疗水平带来更多有用的方式。”

单细胞核糖核酸测序剖析是一个包罗多个大规模数据处置步骤的历程。长时间运行的历程属于盘算麋集型，对内存资源具有很高的要求。盘算时会使用异常大的矩阵，这需要适配内存的容量，同时中央阶段的盘算效果必须保留和重新加载到其他阶段，这都造成了存储和恢复的瓶颈。此外，该历程有许多阶段还必须重复调整参数。

来自MemVerge的Memory Machine软件解决了这些内存资源问题。其ZeroIO™内存快照功效消除了存储IO瓶颈，可显著缩短执行整个scRNA-seq剖析的总体时间。使用下一代测序手艺衍生出的大型矩阵的其他生物信息学剖析，也可以用大内存软件来举行加速。

MemVerge首席执行官范承工博士示意：“到现在为止，内存基础设施还没有存储方面可行的替换方案可供基因组测序使用。大内存以极低的成本提供与DRAM相同的高性能，而且具有庞大数据转达途径所需的持久性和迅速性。”

scRNA-seq测试效果

以使用纯DRAM完成基于R语言的工具的完整剖析作为基准线；再使用Memory Machine软件和DRAM加PMEM组合的内存池重复举行相同剖析。测试解释，使用Memory Machine的执行速率快了25倍，所有阶段总计节约了60%的执行时间。

测试还显示，使用Memory Machine后，数据加载时间加速了800倍。

更大的内存容量允许更多的义务并行运行，并轻松回滚已运行假设的场景。这些优势加上更快的执行时间，使每台服务器的项目吞吐量增添了10倍。

关于百奥智汇

北京百奥智汇科技有限公司是一家具有全球视野的生物手艺企业，公司具备国际前沿的单细胞测序手艺，开发了快速、高效的单细胞组学剖析方式，确立了国际上最大规模的单细胞组学数据库和交互性单细胞数据展示平台，拥有多项单细胞生物信息手艺专利。百奥智汇致力于单细胞基因组学和生物信息学在人类疾病诊断和治疗上的应用，发现新的治疗和诊断靶标、创新治疗战略，确立人类疾病的精准图谱。通过应用和挖掘人类单细胞疾病图谱，百奥智汇将成为新时代新药研发的发念头。

关于MemVerge

持久内存的泛起正在引发大内存盘算的新时代，其中任何规模的应用程序都可以放弃传统存储，转而使用厚实、持久和高度可用的内存池。MemVerge的Memory Machine™软件通过虚拟化DRAM和持久内存来形成企业级内存数据服务平台，使这一切成为了可能。要领会有关MemVerge的更多信息，请接见www.memverge.com。